科研論文又有重大突破——陽江職院以第一完成單位在Cell子刊《iScience》上發(fā)表學術研究論文
近日,陽江職院以第一完成單位在權(quán)威科學期刊Cell子刊《iScience》(JCR Q1、中科院綜合性期刊2區(qū))在線發(fā)表題為“Haplotype-resolved genomics identifies cyp19a1a as a candidate master sex determining gene in golden trevall (Gnathanodon speciosus)”的學術研究論文,該文第一作者是學院食品與環(huán)境工程系范斌博士,這是我校科研工作的又一重大突破。

該研究以具有重要商業(yè)價值的黃金鲹(Gnathanodon speciosus)為研究對象,進行了高質(zhì)量的染色體水平單倍型解析基因組測序,完成了雌雄兩性生成單倍型解析的染色體水平基因組組裝(圖1),以研究該物種性別決定的遺傳基礎,發(fā)現(xiàn)了在這個物種中雌性性別決定與類固醇生成酶家族成員cyp19a1a基因的沉默相關。

圖1:高水平雌雄兩性單倍型解析的染色體水平基因組組裝與分析
該研究在黃金鲹Chr1上發(fā)現(xiàn)識別出一個約90 kb的性別決定區(qū)(SDR)的ZW系統(tǒng)。在SDR內(nèi),cyp19a1a基因在生殖腺分化之前僅從W等位基因表達。cyp19a1a基因上游約1 kb區(qū)域在雌雄之間存在固定變異。報告基因?qū)嶒烇@示,這些變異降低了Z等位基因的啟動子活性,可能沉默了cyp19a1aZ。這表明等位基因多樣化導致了cyp19a1aW作為主性別決定基因的出現(xiàn)。SDR的最小分歧表明性染色體的起源較近。這些發(fā)現(xiàn)提供了關鍵的黃金鲹基因組資源,為揭示其遺傳基礎及性染色體進化提供了重要契機,并對硬骨魚類性別決定進化系統(tǒng)提出了新的見解。

圖2:黃金鲹基因組序列和候選性別決定基因(cyp19ala)分析
《iScience》(ISSN:2589-0042)是Cell 旗下的開放獲取期刊,創(chuàng)刊于2018年,旨在搭建跨學科合作平臺,解決重大科學問題。這本期刊關注生命科學、物理科學、地球科學、健康科學及社會科學五大領域,強調(diào)跨學科研究。本論文由陽江職業(yè)技術學院、陽江海納水產(chǎn)有限公司、上海海洋大學、中國水科院珠江水產(chǎn)研究所、廣東海洋大學、中山大學、陽江市鴻運海水種苗繁育有限公司、華南農(nóng)業(yè)大學和新加坡淡馬錫生命科學研究院等單位合作完成,陽江職院為本工作的第一完成單位。范斌博士為第一作者,王樂和李遠友教授為共同通訊作者。該研究得到了廣東省基礎與應用基礎研究基金(項目編號:2021A1515011123)和廣東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)園(項目編號:GDSCYY2020-011)的支持。
范斌博士系陽江職院青年教師,一直以來深耕深海網(wǎng)箱養(yǎng)殖、金鯧魚品種選育等專業(yè)領域,積極開展教學與科研,探索深遠海綠色健康養(yǎng)殖發(fā)展新模式,致力將海洋變?yōu)椤澳翀觥保蒲谐晒S富,被譽為陽江“魚博士”,2024年被評為陽江市“最美科技工作者”。

